Эта красивая лагуна находится в провинции Сукумбиос, в кантоне Шушуфинди и занимает территорию 4 613 гектар. Средняя температура в этой местности редко падает ниже 250C. Рядом с лагуной Лимонкоча (Limoncocha) находится другая эквадорская жемчужина – Черная лагуна, или Янокоча (Yanococha), поверхность которой кажется темной из-за покрывающих ее зарослей местных разновидностей болотных растений: gramalote и lechuguín.
Вокруг озер сконцентрирована растительность, характеризующаяся как вторичные джунгли, вечнозеленые леса и мангровые заросли. Помимо всего прочего, лагуна Лимонкоча считается единственным биологическим резервом континентального Эквадора, получившим сертификат Рамсар, что означает принадлежность этих мест к болотистым почвам международной важности, учитывая разнообразие обитающих здесь рыб, рептилий и птиц: 464 видов птиц, 74 вида млекопитающих, 92 вида амфибий и рептилий, тысячи видов насекомых.
Здесь развит экологический туризм, с возможностью остановиться на ночь на территории заповедника, но все подобные посещения заранее планируются и организовываются местными туроператорами.
Попасть к озеру можно со стороны городов Нуева Лоха (Лаго Агрио) или Франсиско де Орельяна (Кока). Из Коки путешественники могут достичь лагуны по реке Напо, совершив увлекательную трехчасовую поездку в каноэ или на речном такси, до селения Помпея. От этого селения туристы пешком добираются через сельву до сельского церковного прихода Лимонкоча. Впрочем, от Коки есть и наземный путь, по шоссе в сторону Лаго Агрио до района Саша и, свернув направо, путешественникам придется преодолеть 13 км по грунтовому шоссе.
Заповедник озера Лимонкоча призван сохранять первозданность местных экосистем и обитающих здесь видов, присутствие и воздействие человека минимально. В данной местности разрешается проведение биологических, экологических и иных исследований окружающей среды, уровень ограничения использования – высокий, гарантирующий непрерывность и цельность экологических процессов. Разрешен ограниченный экологический туризм.